Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CMTM6Q9NX76 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CMTM6Q9NX76 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms