Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms