Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms