Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms