Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms