Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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