Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms