Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms