Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms