Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms