Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms