Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms