Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms