Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms