Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms