Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms