Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms