Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms