Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms