Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms