Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms