Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms