Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF397Q8NF99 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms