Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMIEQ8NEW7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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