Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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