Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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