Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC50Q8IVM0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms