Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms