Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00523Q86TU6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms