Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms