Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARMIL2Q6F5E8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms