Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms