Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGO1Q5FBB7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGO1Q5FBB7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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