Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC142Q17RM4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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