Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RTN1Q16799 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RTN1Q16799 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RTN1Q16799 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RTN1Q16799 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RTN1Q16799 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RTN1Q16799 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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