Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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