Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNGA3Q16281 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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