Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms