Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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