Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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