Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CDK5R1Q15078 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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