Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRD3Q15059 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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