Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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