Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IHHQ14623 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms