Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTTNQ14247 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms