Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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EBI3Q14213 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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EBI3Q14213 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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EBI3Q14213 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EBI3Q14213 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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