Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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