Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNC3Q14003 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms