Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RUNX3Q13761 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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