Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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